2 Molekulare Biowissenschaften Jobs in der Steiermark
Ihre Aufgaben:
- Verfassen einer schriftlichen Dissertation im Bereich der Strukturbiologie
- Teilnahme an einem Forschungsprojekt zum de-novo-Design künstlicher, symmetrischer Proteinassemblies, die bakterielle S-Schichten nachahmen
- Molekulare Klonierung, heterologe Proteinexpression und Proteinreinigung
- Biophysikalische Untersuchungen von Proteinen und deren Assemblies (unter Verwendung von Methoden wie ITC, MALS, SAXS, CD, Fluoreszenzmikroskopie)
- Strukturelle Charakterisierung von Proteinassemblies (z. B. Elektronenmikroskopie, Röntgenkristallographie oder verwandte integrative strukturbiologische Ansätze)
- Entwicklung und Analyse von Proteinassemblies als Gerüste zur räumlichen Kontrolle von Enzymkaskaden
- Funktionelle Rekonstitution von Multi-Enzym-Kaskaden auf designten Proteinassemblies
- Anwendung des computergestützten Tools SymProFold und verwandter prädiktiver Methoden zur Analyse von Dynamik, Kontaktstellen und Schlüssel-Interaktionsmotiven innerhalb von Proteinassemblies
- Dokumentation und Analyse experimenteller Daten; Präsentation der Ergebnisse bei Gruppentreffen, Seminaren und Konferenzen
- Beitrag zu allgemeinen Laboraufgaben und zu einer kollaborativen Umgebung im BiotechPredict doc.funds-Programm
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Ihre Aufgaben:
- Verfassen einer schriftlichen Dissertation im Bereich Computational Biology / Strukturbioinformatik
- Teilnahme an einem Forschungsprojekt zu dreidimensionalen Datenrepräsentationen für die Annotation von Proteinfunktionen anhand von Sequenzdaten
- Erstellung dreidimensionaler Strukturrepräsentationen von Biokatalysatoren aus experimentellen Strukturen und AlphaFold-Modellen, kodiert als volumetrische (Voxel-) und Punktwolken-Darstellungen
- Entwicklung, Training und Benchmarking von Machine-Learning-Modellen zur Annotation von Enzymfunktionen anhand von Sequenz- und Strukturdaten
- Analyse von aktiven Zentren und räumlichen Merkmalen von Biokatalysatoren zur Verbesserung der Annotation von Enzymfunktionen aus Sequenzdaten
- Integration von Deep-Mutational-Scanning-Daten zur Bewertung, wie der strukturelle Kontext die funktionellen Auswirkungen von Mutationen beeinflusst
- Kuratierung und Aufbereitung von Trainingsdatensätzen zu Biokatalysatoren aus öffentlichen Datenbanken und kooperierenden Projekten innerhalb des BiotechPredict-Konsortiums
- Anwendung und Weiterentwicklung computergestützter Werkzeuge zur Proteinstrukturvorhersage und struktur-basierten maschinellen Lernverfahren (z. B. AlphaFold, ESMFold, 3D-CNNs, Graph-Neuronale Netze oder verwandte Ansätze)
- Dokumentation und Analyse der computergestützten Ergebnisse; Präsentation der Resultate bei Gruppentreffen, Seminaren und Konferenzen
- Beitrag zu allgemeinen Gruppenaufgaben und zu einer kollaborativen Umgebung im Rahmen des BiotechPredict doc.funds-Programms
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